◇◇新语丝(www.xys.org)(xys4.dxiong.com)(www.xinyusi.info)(xys2.dropin.org)◇◇   匪夷所思的评选   作者:种田农民   刚刚在科学网看到2009中国10大基础科学研究进展的评选结果 http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2010/1/227264.shtm 大部分不在我的智 力范围,无法判断其优劣。   但这一项:“鉴别出与超级杂交水稻杂种优势相关的潜在功能基因”,对研 究内容我略知一二。估计就是指的这篇文章 http://www.pnas.org/content/106/19/7695.full?sid=4dd3335d-aa1c-4626-92 82-a771cf22b8a8。这篇文章是袁隆平当选美国院士后的就职文章,尽管他也名 列4名通讯作者之一,但我更认为作为从事应用研究的袁先生估计是被“绑架” 到这一有重大突破的基础研究论文上的。我认为其或许写一篇中国超级水稻发展 战略思考等一类的观点文章,可能比这篇文章的意义更大(当然这仅是个人臆 想)。作为美国科学院院士,一个直接的好处就是可以自己写文章也可以推荐文 章到PNAS上发表,而不需要一般意义的严格的peer-review过程。可是作为袁院 士的就职文章,发表却并不顺利,从投稿到接受发表花了2年还多的时间,也是 比较罕见的。当然我们也可以说,袁院士很严谨!找的reviewer都很认真。   再来说说文章的内容,杂种优势是百年难题,尽管发表的相关文章有一堆 (比如2010年第一期的TAG,就是杂种优势的专辑,伴随玉米基因组出来的 science系列文章,也有一篇是谈玉米杂种优势的),但迄今为止,尚没有人敢 说搞清楚了这个神奇但又非常复杂现象的机理。也没有任何与杂种优势有关基因 被鉴定和克隆(其实是否真的存在直接控制杂种优势的基因,目前还需要打一个 天大的问号)。就获奖的这个研究而言,利用芯片来差异表达亲本和F1不同时期 的组织,获得一堆差异表达的基因,然后推导影响杂种优势形成的可能成因,是 我读博士的时候(也就是10多年前)DNA 芯片开始流行的时候,火热的一个话 题。随着下代测序技术的发展和表达芯片本身天然存在的过高的假阳性,这种研 究思路渐渐淡出人们的视线了,其实这种技术诞生的同时伴随着的就是无数的争 论。尽管文章可以检索到无数,但真正有结论东西了了。PNAS这篇文章也没有逃 出这个套路。   给的评价是,鉴别出与超级杂交水稻杂种优势相关的潜在的功能基因,用了 两个限定词(相关的,潜在的),你就知道其实这个结果有多玄乎,从文章看, 这种差异表达的基因数千个,说等于没有说。其实,我们可以说水稻基因组的任 何一个基因都是影响水稻杂种优势的潜在功能基因(这个说法不是钻牛角尖,而 是有相当的科学依据)。因为,目前的数据标明,不同的杂交组合,差异表达的 基因也不同,一个给定的组合有10%的基因差异表达而推测与杂种优势有关, 如果我们鉴定更多的强优势组合,比如100个,我们最后可能发现,所有的基 因都差异表达。   PNAS文章的结果是否有意义,回答是当然有。但其意义多大,是否值得评为 年度10大进展之一,我认为不管从其研究思路的创新性,研究结果的新颖性等 方面来说都值得商榷! (XYS20100120) ◇◇新语丝(www.xys.org)(xys4.dxiong.com)(www.xinyusi.info)(xys2.dropin.org)◇◇